15日夜晚，大批日军士兵闯入金陵大学校舍，当场强奸妇女30人，有几名妇女甚至被六人轮奸，在安全区其他一些地方，当晚也发生同样的事情。
另一支日军来到一个收容所，宣称有6000名解除了武装的中国军人进入了安全区，必须把他们搜索出来。于是青壮年人人过关，穿军服的，当过兵的，自是在劫难逃。即使是平民百姓，只要手上有茧，肩上有趼，也难逃厄运。日本兵把他们从人群中抓出来，甩绳子缚着，每100人圈在一起。
国际委员会的委员们正在煤油灯下召开会议，听到报告，拉贝带着委员们急忙赶了过来。他气喘吁吁地向日本军官交涉、争辩着，可是无济于事。费区在队伍中急忙地穿来穿去，他想寻找到昨天向他交枪的四个小个子广东士兵，他们是怀着满腔报国之志来到抗日前线的，壮志未酬，实在不愿意放下武器，说话时眼睛里还燃着熊熊的火焰。还有一个大个子的北方军官，他曾满怀惆怅地向费区倾诉了战败后的痛苦和遗憾，那一双深深凹陷的失望的眼睛，令他毕生难忘。他想找到他们，哪怕再看上一眼，哪怕稍稍表示一下自己无能为力的痛苦和遗憾。可是他找不到他们，也许他们早已被圈进被缚的人群中间去了，等待着他们的，将是死神的咆哮和狰狞。
【德国西门子洋行中国总行南京分行经理拉贝，由于他正直的品格和德国国籍且又是纳粹党员这一特殊身份，被公推为南京安全区国际委员会主席。】
1300多人被全部捆绑完毕，日本人命令他们排着长队向马路上走去。刺刀的寒光在星月下闪耀着，没有叹息，没有哭泣，1300多人在马路上缓缓地移动，只有痛苦和悲哀深深地压在人们的心底。
费区忽然拔腿向前奔去，不顾日军的吆喝和阻拦，拼命往前挤。朦胧中眼睛倏然一亮，他终于看到了那几个熟悉的影子，是的，是他们，确是他们！那几个小个子广东兵！费区挨了过去，而且大声嚷叫起来，向着日本士兵拼命打手势，试图解救他们。日本士兵不但没有理睬，并且把他往外推。
几个小个子广东兵被费区的声音惊动了，他们转过头来，费区明显地感到，他们的目光是那样地绝望和痛苦，不觉心里涌上一阵深深的痛楚，他在路边愣愣地站着，悲痛难言。
一会儿，不远处忽然传来急促的机枪扫射声，夹杂着人们的呻吟、惨叫和怒骂声。拉贝气得浑身发抖，觉得自己受了欺骗和愚弄，而他又欺骗了别人。下午的许诺还在耳边回响，晚间的安全区却充满血腥、屠杀和狰狞。他气得右手握拳在空中拼命地挥动，一边大声地吼叫着：“骗子！可耻的屠夫和骗子！”
12月16日，情况愈趋恶化，大批日军涌入安全区内，四处搜捕和屠杀解除武装的中国军人和平民百姓。
鼓楼五条巷4号难民区内，中国军民石岩、陈肇委、胡瑞卿、王克林等数百人，被日军搜捕驱集在大方巷广场上，以机枪射杀；
在傅佐路12号，平民谢来福、李小二等200余人，被日军押往大方巷塘边枪杀；
在中山北路前法官训练所旧址，平民吕发林、吕启云、张德智、张德亮、张德海等100余人，被日军捆绑拖至四条巷塘边，用机枪集体射杀。
……
安全区内，到处是机枪疯狂的吼叫，屠刀罪恶的血腥；到处是妇孺悲惨的呼号，老人痛苦的哀鸣。刽子手狞笑着，肆意宰杀着国际的准则，人类的公理、道义和良心。
大胖子拉贝带领国际委员会的委员们，四处奔走交涉，但日军当局的答复却是：难民区内隐藏着两万名解除武装的中国军人，皇军必须统统将他们搜捕出来。
六千名上升到两万名，这意味着更大的搜捕和屠杀将接踵而来！
傍晚，拉贝拖着沉重而疲倦不堪的身体，回到广州路小桃源10号的住宅。这儿收容了几百个难民，住宅的屋顶上，纳粹党旗帜高高地飘扬；宅院的大门上，日本军方的布告写着赫然的禁令。然而，这一切都无济于事，当他跨进院门之后，两个日本士兵的丑态马上闯入了他的眼帘：一个正在洗劫财物；另一个解开裤子正压倒在一个姑娘的身上。拉贝感到热血往头上直涌，脸孔涨得通红，他大声吼叫着：“滚出去！给我滚出去！”一边挥动着粗大的手臂。
日本士兵慌忙回过头来，看见手臂上那威严的国社党图案的臂章，赶紧爬了起来，提起裤子光着屁股往门外逃窜。拉贝挡在大门口，愤怒地指点着：“从哪里进来的，你们从哪里出去！”日本士兵乖乖转过身子，从围墙上爬出了院子。
回到房间，拉贝正准备坐下来休息，侍役进来报告说，白天来了几个日军，劫走了一辆汽车，留下一张条子，上面写着：“谢君厚礼，日军佐藤。”
余怒未息的拉贝，怔怔地望着这张条子，金丝眼镜后面，那蓝色的眼睛蕴含着无尽的疑惑、忧虑、愤怒和惋惜，良久，发出一声长长的叹息。短短几天，他对自己祖国的盟友日本的军队，已经是彻底地失望了，这哪里像一支军队啊，简直是一群强盗和土匪！
安全区内，日军暴行不断，国际委员会逐日进行记录，拉贝便每天带着国际委员会的公函和暴行记录，前往日本大使馆和日军司令部，进行交涉和抗议，但收效甚微。
一天，有人来报告说，古平岗发现两个军用仓库，是中央军撤退时丢下的，里面尽是些硝磺、子弹还没处理，该如何办？拉贝一听急了，对一个大个子临时工招了招手。那个工人马上走了过来。
“你叫什么名字？”拉贝问道。
“我叫袁存荣。”
“袁存荣，你是中国人，有一件对你们中国人很重要的事情，叫你干，你敢不敢干？”
“什么事情，你讲吧！”袁存荣点点头。
拉贝神情严肃地说：“在古平岗发现了两个军用仓库，是中央军撤退时丢下的，全是硝磺、子弹，要是给日本人拉去了，又要杀死你们多少中国人啊！你敢去把它破坏掉吗？”
袁存荣连声说：“去，去，我这就去！”
拉贝又问：“你知道怎样破坏它吗？”
袁存荣摇了摇头。
拉贝拍了拍袁存荣身上的大褂，告诉他说：“你要用褂子兜上一兜硝磺，接着用手在地上撒一条长线，记住，线要撒得长长的，接着点上火柴。”
晚上，袁存荣乘着夜幕，七弯八拐，绕过日军岗哨，来到古平岗公园。摸进仓库，借着窗外朦胧的月色，他看到两个仓库满满的全是硝磺和子弹。袁存荣按照拉贝教授的办法，用大褂兜上许多硝磺，撒了一条长线，接着小心翼翼地点上火柴。人还没动就听见轰然一声，屋顶起来了，砖瓦、木板炸飞了，火苗往上直冲，袁存荣爬起身拔腿就跑，身后传来了子弹噼里啪啦的爆响声。
拉贝那沉重而焦虑的脸上，露出了短暂而难得的微笑。