左宗棠所上《金军未能迅速出关折》拜发不久，圣旨开始陆续抵达肃州。
第一道圣旨：不准左宗棠开缺回籍，但赏左宗棠一个月病假，安心调理，军情可随时奏报。
第二道圣旨：考虑到新疆的实际情况，朝廷同意金顺一军暂缓出关，但却命令左宗棠“金顺需要粮食、车驼等项，仍命左宗棠饬令该地方官速为预备，毋稍延误”。
接旨的当日，肃州回目马文禄，自缚双臂，出城赴大营请罪乞降，请免全城回兵一死。左宗棠允之，转饬马文禄命城内回兵次第出城，缴械受抚。马文禄不敢抗命，一切照办。
刘锦棠统军从四门进入肃州接防，料理善后。越五日，马文禄眷属及麾下得力大小头目一千五百七十三人，被秘密斩杀，一部回众被遣往兰州择地安插，一部回众被送往凉州，一部留肃州。
至此，除新疆外，陕甘两省全境平定。左宗棠在向朝廷拜发红旗捷报的同时，又附《请敕张曜、额尔庆额带所部出关并简重臣总司粮台》一片，奏请嵩武军张曜所部、凉州副都统额尔庆额所部，先金顺一步出关，用于加强新疆的兵力。
左宗棠在该片的最后这样写道：“如蒙俞允，张曜、额尔庆额应请敕帮办金顺军务，俾尽其赞画之长，庶期共济。”
左宗棠随后又给总理衙门急函一封，谈了自己对新疆用兵的看法。
在函后，左宗棠又向总理衙门提出：“饷项奇绌，请仍准以四成洋税提拔甘饷。”
以后的一个月，为了能使张曜、额尔庆额两部人马，接旨后顺利出关，左宗棠不得不派几路委员，赶赴内地紧急采购军食，又飞函上海采运局的胡雪岩，速借洋款五十万两以应急。
金顺，字和甫，满洲镶蓝旗人，伊尔根觉罗氏。初授骁骑校尉，随多隆阿在湖北、安徽同太平军作战，因巴结有方，得多隆阿保举晋协领。陕甘回民起义，被穆图善奏调至陕甘作战，却累战累败。穆图善却称其不屈不挠，英勇善战，被朝廷升授镶黄旗汉军副都统。就是这样一个作战无方、冒功有术的庸员，同治五年（公元1866年）竟然出任宁夏副都统，同治八年（公元1869年）暂代宁夏将军，同治十年（公元1871年）擢乌里雅苏台将军，发达得连他自己都不敢相信。
张曜又是何许人呢？张曜字亮臣，号朗斋，直隶大兴人，初不通文墨，却很会打仗。先在河南固始参与办团练，后自募一军，在汝宁击败陈大喜、张凤林所部捻军，被任为河南布政使。同治初，御史刘毓楠参劾其目不识丁，将其由文官改为武职，以总兵加提督衔，被降格使用。张曜从此发愤读书，始通文墨。同治五年（公元1866年），为与捻军交战，河南巡抚李鹤年募军两支，一为豫军，一为嵩武军。其中豫军由宋庆统率，嵩武军则交由张曜统率。同治七年（公元1868年），率嵩武军赴直隶、山东剿捻。捻平，授广东陆路提督，派往陕西攻回，现驻镇番一带休整。
额尔庆额，字蔼堂，满洲镶白旗人，格何恩氏，以骁勇闻名于世。被穆图善调入陕，因收复狄道赐号法福灵阿巴图鲁，授黑龙江马队副总管，旋被穆图善保举为凉州副都统，仍统带所部马队，现在凉州休整。
左宗棠密举张曜、额尔庆额先期出关，去配合景廉收复乌鲁木齐，是因为二军都已经经过长时间的休整，能够一鼓作气开抵乌鲁木齐，不致贻误军机。
就当时的陕甘兵力而言，除张曜、额尔庆额二军，能在最短的时间内开出关外，其他各部如无长时间的休整，很难担负起长途跋涉的任务。左宗棠不愧为兵事大家。
左宗棠的折子递进京师，朝廷很快下旨照准。
接旨的当日，左宗棠即派出快马转饬张曜、额尔庆额二人，命其快速出关，驰赴乌鲁木齐。二将接命，很快传命各营打点行装，并于十日后，各率所部行抵肃州领取三个月的军粮，便由嘉峪关出关西行。二将走后不久，金顺亦统带本部二十营一万余马步兵勇，浩浩荡荡出关。左宗棠酌派精悍兵勇，押护运粮驼队跟进。
送走驼队，左宗棠猛然松一口大气，只感觉浑身些丝力气皆无，再次瘫倒在床。随侍的侍卫慌作一团，一面请军医诊病，一面飞跑着去向刘锦棠报信。
刘锦棠飞马赶到大营，见左宗棠腿肿脸膀，沉沉昏睡，两名军医正在开方下药，忙个不休。刘锦棠一边落泪，一边向军医小声探问左宗棠病情。
军医把刘锦棠拉到外面，小声道：“老爵帅病已很深，不好好调理一下是不行了。他老病未痊愈，到肃州后，竟连一日都不得安歇，这不是在赌命吗？以往发病，身边还有个香姨娘精心照料，可此次……刘大人，爵帅醒后，您老务必劝他回兰州吧。他老若再不好好歇上一阵，恐怕就算把圣手华佗请到，怕也要束手无策了！”
刘锦棠泪流满面道：“新疆事急，您让他老如何能静得下心去歇呀！”刘锦棠连夜派出快马，向穆图善通报左宗棠病重的消息。穆图善接报一阵狂喜，马上便让文案拟折，奏请朝廷速派大员赴兰州接替左宗棠料理陕甘事务。
折子拜发后的一连几日，陕甘总督的关防总在穆图善的眼前晃动。
同治十二年（公元1873年）十月初七这一天，是左宗棠六十一岁寿诞。六十一年前的这一天，左宗棠在湖南湘阴文家局左家塅降生；六十一年后的今天，恐怕连他自己都没有想到，他会在这里过生日。
时令已是深秋，肃州一带已连降了十几天的大雨。但这一天，阳光却出奇地好，既无雨，也无风。
刘锦棠为使左宗棠能过一个热闹的生日，不仅让属员采购了许多的时鲜菜蔬，又特意从山西购买了一头大肥猪运到肃州，着人秘密杀掉，为左宗棠摆寿宴时食用。左宗棠原本最喜食猪肉，但到陕甘后，因风俗等因，陕甘一带无猪可买，左宗棠只好入乡随俗，改吃牛羊肉；但每逢有大的战绩，在庆功宴上，左宗棠却总要私下同刘锦棠等将领讲上一句：“这时能吃上一口猪肉，那是再好不过的了。”
刘锦棠知道左宗棠入陕以来，一直想吃顿猪肉，所以就在一个月前背着左宗棠，秘密派遣了一名守备，赶赴山西去采购肥猪，想在左宗棠过生日的时候，给左宗棠一个惊喜。
朝廷原本对有功大员的生辰都记录在案，按远近推算，在大员的生日之前，吏部或兵部就要奏明军机处，由军机处上报朝廷，由朝廷派出快马向大员颁赐赏物，以示体恤；朝廷颁赐的赏物，无论远近，都要赶在大员生日的这一天上午送到。大清立国至今，一直如此，从无更改。
左宗棠生日的这一天虽在生病，但为了接领赏物，一大早，他还是勉强起床，由亲兵服侍着，换上簇新的官服、顶戴，坐进大帐里。一为迎接来祝寿的文武官员，一为接旨。
刘锦棠已着人置办了十几桌酒席，只等左宗棠接领赏物后，便开席畅饮。
各路将领开始陆续到达肃州，见过刘锦棠后，便在刘锦棠的带领下，一起来到大帐，向左宗棠祝寿。各州县原本也打算在这一天到肃州给左宗棠祝寿的，但因左宗棠提前几天发了函文，不许地方官员擅离衙门，否则严参，这才不得不作罢；但心里还是欢喜的，毕竟省了一项花费。
各路统兵将领却又与地方官员不同，一则他们在这一天不仅不用花费，反倒可以为自己所部各营领到一个月饷银，还能饱餐一顿。他们毕竟与左宗棠出生入死了几年，交情自然要比地方官员厚上许多。
各路将领见过左宗棠后，自然分坐两边，一边喝茶，一边说些闲话，其实是陪着左宗棠在等着朝廷的赏物到达。
但这一天却煞是作怪，眼看日到中天，赏物仍未到达，左宗棠有些沉不住气了。他苦笑一声起身道：“毅斋呀，我们开席吧。各位统领赶了一路，想来早已饿坏了。本部堂活到今儿，整整是六十一岁，我们大家要尽兴才是。”
刘锦棠抢前一步扶住左宗棠，小声道：“世叔，不差这一刻，再等等吧。说不定，差官已到辕门了。”
左宗棠摇头道：“不等了。不能因我一个，误了大家开饭。毅斋，扶我去饭厅。”
刘锦棠拗不过，只好扶着神情落寞的左宗棠当先走出大帐。到了饭厅，各将领依座次入席。左宗棠因病不能饮酒，面前只摆了一杯浓茶。
刘锦棠见全部入座，便站起身，手举酒杯，正想对左宗棠说几句“福如东海，寿比南山”的祝寿话，传旨差官却偏在这时，风尘仆仆大步闯了进来。
随着一声“圣旨到，左宗棠接旨！”的喊声，左宗棠带着所有人急忙跪倒，恭听圣谕。
传旨差官读道：“内阁奉上谕：昨因肃州克复，已降旨将在事出力之刘锦棠、徐占彪等分别优奖。因思陕、甘逆回扰乱十有余载，势极狓猖。自简任左宗棠总督陕甘，数年以来，不辞艰苦，次第剿除。此次亲临前敌，督饬将士，克复坚城，关内一律肃清，朕心实深嘉悦，自应特沛殊恩，用昭懋赏。经礼部会议，恭亲王奏请，钦赐左宗棠进士出身，赏加翰林。左宗棠着以陕甘总督协办大学士。该大臣前经赏给骑都尉世职，并着改为一等轻车都尉世职。钦此。”
差官宣旨毕，大厅一片寂静，人们仿佛傻了一般。差官不得不走到左宗棠的跟前，小声说道：“老爵相，您老怎么不领旨谢恩啊？”
一句“老爵相”，使左宗棠猛然清醒，他至此才真正地意识到，一榜出身的他，真的被朝廷破格拜相了！他双手接过圣旨，连连面北叩头谢恩不止，起身时已然泪流满面。左宗棠此时内心的激动充溢着全身，根本无法掩饰。
送走传旨差官，刘锦棠带着众将领重新跪倒，向拜相的左宗棠祝贺。左宗棠嘶哑着嗓子边哭边道：“都起来吧，都起来吧。朝廷如此破格加恩于老夫，全是各位的功劳啊！老夫何德何能受此殊恩哪！”
刘锦棠替左宗棠扶起各位将领后，又对左宗棠说道：“老爵相啊，我大清立国百年，区区乡间举人拜相的，可就您老一个呀！朝廷这是破了祖宗立的家法呀！”
一闻此言，刚刚平静下来的左宗棠，再次激动得浑身颤抖，泪流满面。大清官制，不仅一榜不能拜相，未被钦点翰林院庶吉士的普通进士，也不准拜相。为了能使功高盖世的左宗棠入阁拜相，又能堵住百官的嘴，朝廷只得用了个障眼法：钦赐左宗棠进士出身，赏加翰林。这样一来，别人就不好再说什么了。