世界杯失利的痛苦只有慢慢去咀嚼，而足球不会因为一个人一个球队的痛苦而停止其运转的脚步。从世界杯归来后，巴乔并没有得到大多的时间去洗却世界杯带来的身心疲惫，他必须马上振作精神，为新的俱乐部备战新赛季的意大利甲级联赛。而这一次，他选择了重返来兰。不过他加盟的并非他的老东家AC米兰，而是它的同城兄弟国际米兰。他转会国际米兰在去法国世界杯之前就已经基本敲定了。可以这样说，这次加盟国际米兰算得上是赴三年前的约了。1995年夏，当尤文日斯排挤巴乔之时，国际米兰俱乐部的老板莫拉蒂就曾向巴乔发出了邀请，希望巴乔来为国际米兰的复兴而奋斗。巴乔后来虽去了米兰，但却不是去国际米兰，而是去AC米兰，这多少有些让莫拉蒂脸上无光。
由于巴乔加盟博洛尼亚后表现非常出色，一扫在AC米兰的颓气，成为了球队的核心，因此，在1998年的1月，莫拉蒂就暗中展开了一些攻势。不过后来由于爆出了巴乔与博洛尼亚队主教练乌利维埃里闹矛盾的“罢赛事件”，莫拉蒂又暂停了与巴乔的接触，因为他不想给人留下乘人之危的印象。而且当时巴乔还处于犹豫之中，他当时接到了国际米兰队主帅西蒙尼力邀他加盟的电话，巴乔在电话里对这位热情的主教练说：“我很愿意立刻就到国际米兰去，但我知道许许多多博洛尼亚的球迷从我到博洛尼亚一开始就给了我极大的支持和信任，现在我要是离开他们，他们会把我当成叛徒，请你理解我现在的心情。”西蒙尼并不了解巴乔的为人原则，他以为巴乔与博洛尼亚队主教练闹矛盾，就是力邀巴乔早日加盟国际队的最好时机，可巴乔是一位非常讲情义的人，他不会在球队最需要他的时候突然离去。 那段时期，西蒙尼教练从不放过一切可以和巴乔见面的机会，他几乎每周都要不断与巴乔通电话。西蒙尼是一位历经许多挫折的老教练，他先后执教过热那亚队、布雷西亚队、比萨队、拉齐奥队、恩波利队、科圣察队、卡拉那队、克雷莫纳队、那不勒斯队，可是很少取得成功，他总是不停地被球队解职，扮演一个可怜的角色。现在执教国际米兰同样面临巨大压力，成绩稍有不好，球迷们就轰他下课，他非常希望巴乔能早日到来以助球队取得联赛冠军，在他的执教生涯中，连一次冠军都还没有得过，因此他的心情如此急迫是可以理解的。但心急吃不了热豆腐，巴乔不可能在赛季还没有结束就离开博洛尼亚。后来，巴乔与乌利维埃里冰释前嫌，巴乔在联赛上的表现也愈加出色。国际米兰只好等到赛季快结束时再次坐下来与博洛尼亚俱乐部商讨巴乔转会一事。 国际米兰再次想到引进巴乔是有其原因的。自从“外星人”罗纳尔多加盟国际米兰以来，国际米兰的成绩确实有很大提高，在1997-1998赛季的积分榜上一度领先于群雄。但是，球队总让人感到还缺一点什么，罗纳尔多还缺一位好的传球队员与他进行配合。国际米兰现有球员法国人德约卡夫由于该赛季状态不佳，引起了球迷和教练的不满。莫拉蒂看中了巴乔出色的组织进攻的能力，他迫切希望引进巴乔来与罗纳尔多配合，进一步加强球队的实力。
1997-1998赛季的联赛终于结束了，整个意大利的球迷们都把注意力集中在法国世界杯赛上，而关于球员的转会，也只有罗伯特·巴乔的去向才能引起公众的关注。巴乔本人确实希望到国际米兰去开拓自己的新天地。从巴乔个人来看，以下这些原因是他决定去国际米兰的关键：首先，国际米兰是意大利三个超一流俱乐部之一，在意大利球迷心中有举足轻重的影响，国际米兰队已取得了下赛季参加欧洲冠军杯附加赛的资格，这项大赛是巴乔渴望参加的。他自知自己可能已没有机会再去参加世界杯赛了，代表强队去参加欧洲三大杯赛并力争获得冠军就成了他未来足球生涯新的梦想。其次，国际米兰俱乐部的老板莫拉蒂一直对巴乔情有独钟，多次表示国际米兰欢迎巴乔的到来，巴乔对莫拉蒂的赏识心存感激，他深知莫拉蒂重振国际米兰的坚定信心，愿意去一个有雄心壮志的球队踢球。此外，巴乔个人对国际米兰也颇有好感，自小就和家人一起支持该队。就是在联赛结束的同时，巴乔转会国际米兰的事也基本敲定，国际米兰的官方网站率先发布了这一消息。 在意大利国家队世界杯赛前的集训基地，一位摄影记者用长镜头拍下了一张照片，照片上穿运动服的巴乔与国际米兰的老臣贝尔戈米笑容可掬地拥抱在一起。人们据此推断，巴乔正式加盟国际米兰已是不可更改的事实了。
由于博洛尼亚队深知巴乔自小就是国际米兰的球迷，而且他们也相信巴乔在国际米兰这样的大球队会取得更大成就，因此他们根本没有去阻止巴乔转会国际米兰，他们的要价也非常地低，只有区区两百万美元。转会协议是在世界杯开赛之前签好的，意大利国家队在瑞典打完热身赛回到国内后，巴乔抽空与国际米兰最后敲定了合同的细节，使自己如愿重返米兰。