《东方不败：风云再起》讲述的是仍由拍摄《笑傲江湖贰之东方不败》的程小东执导，但故事并不延续。
练成神功的东方不败欲一统天下，但黑木崖一战使之全军覆没，自己也身负重伤，从此不见踪影。
东之爱妾雪千寻重整日月神教，只为等他重现。水师提督顾长风偶上黑木崖遇到东方不败，却被其点了穴。
东方不败重现江湖，在杀遍冒充自己的人后找到雪千寻，下重手与她了断情缘。
顾长风不计前怨将雪千寻救出，并生爱慕之情；但雪千寻对东方不败旧情难忘。
东方不败欲再一统江湖，顾为制止率水师与之决一死战。雪千寻已死，东方不败手抱爱妾略有所悟。
东方不败于黑木崖大战之后，殒然消失，群龙无首，武林进入了混乱时代，名方之士皆以东方不败之名自组势力，而东方不败之爱侣雪千寻再兴日月教，以图延续他东方不败的盛世，朝廷为平反，派锦衣卫顾长风及西班牙古烈大将军往寻东方不败身死之谜，顾对东心仪已久，他在崖底遇见了东方不败，说服了东方不败重出江湖，于是，引发了连场的武林杀戮，最后只剩东方不败独立船头，悄然而去。
古烈将军他们来到黑木崖，居然不知道中国人说的江湖，也不知道中国人说的武林，真的很奇怪的啊，难道外国的地盘上没有这些的江湖和武林的吗？
这些外国人，还是一边走，一边驱魔。古烈将军来这里是来找葵花宝典的，这是一本武功秘籍。
可是顾长风却是说带古烈将军来找荷兰船的残骸，不是找葵花宝典，他们看到了东方不败的坟墓，为什么还是不相信的呢？
还要挖坟，我的天哪。不过最后的时候顾长风却是发现了东方不败，居然还活着，在这样的一个世界上，我才发现其实东方不败是很有实力的，居然这么多年了还活着，还一直躲在黑木崖，顾长风说了很多的话，说外面有很多的东方不败，所以他为了一睹东方不败的芳容，死也值了，就这样的一个人，说起来是有一些的傻的吧，不过还是没有被东方不败杀掉，东方不败也是自己把他扔在河里的，可是就这样的看着鱼来了却有把他救了上来，也是源于刚开始的时候顾长风也是拼命的护着东方不败的坟有关的吧，所以顾长风说，你不杀伯仲，伯仲却是因你而死。
还发出感叹，天地有情尽白发，人间无意了沧桑。就这样，顾长风带着东方不败去揭露那些假东方不败的真面目，可是顾长风却是要东方不败答应自己，不要再杀人了，东方不败也是要顾长风答应不要揭露自己的身份，那样的话她是会杀人的，还会杀了他的。
东方不败的人去苗族的时候，居然有那么多的人崇拜东方不败，还是有那么多的人连怎么因为什么都不知道就血祭，可是东方不败明明是答应顾长风的，说是不杀人的，可是还是杀了人，就这样的一个人，是一个魔头，为什么还是有那么多的人把他当神一样的敬着呢？
我的天哪？天气干旱怪谁呢？谁也不怪的吧，东方不败给了他们什么呢，事实上什么都没有给他们了，怎么会有这么多的人崇拜他呢。
他们还是说自己崇拜东方不败，连真正的东方不败都不认识，还怎么崇拜东方不败呢？
第二个冒充东方不败的人是雪千寻，他这样的一个人一直都是在等教主的出现，可是教主的出现却是为了埋葬这一切的，这真的是一个梦幻般的故事吧，东方不败想做的事情是没有人能阻挡的，他不想做的事情也是没有人阻挡的。
结果在打斗中，雪千寻说了一句话，死并不可怕，孤独的活着才是痛苦的。
最后的时候顾长风决定救雪千寻，虽然雪千寻只是一个他的敌人，而这个时候他的部下却是临危脱逃，杀了他的那个部下之后才知道自己是受了重伤的，他还是要救雪千寻，因为他总是觉得是自己把东方不败给引出来的，不过东方不败杀的人他只能去承担后果，去救这些人了。
他和汗青就这样的救下了雪千寻，不过他们遇到西班牙战船的时候，他们说的话，为什么那些日月神教的人不相信呢？
结果呢？白白的死掉了那么多的人，值得吗？他们也是发现船快沉了，才挂着帆走的，最后在一片竹筏上，他们两个划着船，雪千寻在上面躺着，这样的恩情对于雪千寻来说，真的是最大的恩情了。
最后东方不败找到了雾隐雷藏，还真的是很逗的，东方不败居然去了那些**的队伍里，这些**却是很害怕的，可是她一点都不害怕的样子，还是和他们赌输赢，雾隐雷藏输了，要砍下双腿的，可是这个人却是不坎，东方不败说，你不坎也是会有人来取的。
最后才发现这个雾隐雷藏是假的，是别人假扮的了。可是在田启云这里，有了很多的东方不败了，他的那些个女人都是东方不败啊，他还是喜欢雪千寻的，在这样的一个场合，还是想让雪千寻做他的女人，可是顾长风一直在帮助雪千寻，最后顾长风也扮演东方不败了，不过他和田启云的一场战斗也真的是很快就结束了，这个田启云也是很逗的，一直都是喜欢玩，就这样的被顾长风点了笑穴，就这样的一直笑，一直笑的样子了。
顾长风就这样的和东西方不败战斗，他们也是在努力的战斗着，可是东方不败还是没有出现，顾长风已经打的筋疲力尽了，东方不败还是没有出现，可是顾长风却说，每个人在最后都是希望遇到最强的敌人。
这样真的把东方不败给引了出来，不过这个时候的东方不败，却是已经改变了自己，改变了对雪千寻的看法，只是有点晚了，雪千寻已经死去了，什么都听不到了，这个人一直都很衷心自己的教主，为什么会这样的呢？
最后的结局有一点点的小小的遗憾了，雪千寻死了，不过东方不败也是意识到了不少的事情了，他一直都想做自己，都这样的独来独往的，所以身边的人都失去了，最后的时候我想东方不败是想通了吧.............