大荒神帝神农氏于南际山仙去，临终之际，结识流浪少年拓跋野。其时大荒内乱将起，黑水真神蚀龙日渐张狂，竟派遣兵将围剿大荒中的自由之邦——蜃楼城。为解大荒之乱，拓跋野临危受命，携神帝血书令符踏上大荒。
途中，拓跋野屡逢奇遇，并于深崖寒潭之中，伏灵兽白龙鹿，得木族神剑。此时翠屏山中，水妖龙女雨师妾张网以待，轻松俘获拓跋野。多情龙女雨师妾，翩翩少年拓跋野，两人日久生情，不能自拔。其时蜃楼城声势日大，各族游侠皆前往声援。荒郊野栈，白发浪子科汗淮力挫群雄，令拓跋野心折。在科汗淮的带领下，众游侠突破水妖封锁线，终得以进入蜃楼城。拓跋野身为神帝使者，血书令牌一现，水妖重兵悄然撤退。蜃楼城中，拓跋野与城主乔羽之子蚩尤脾性相投，结为好友。科汗淮之女纤纤年龄与他们相仿，也相处甚欢。好景不长，水妖夜袭蜃楼城。因为内奸的出卖，自由之邦一夜倾城，科汗淮、乔羽下落不明，拓跋野、蚩尤、纤纤饮恨漂泊。
三人漂流至大荒罪囚的流放地——汤谷岛，却阴差阳错地被众囚奉为神人。二少年将错就错，以汤谷为根基，组建汤谷军，期重振蜃楼城。蚩尤更自机缘巧合，吸收了被困汤谷多年的前木族青帝羽卓丞元神，并得本族神器——苗刀。
其时水妖势力渐长，东海之上，汤谷军大败水妖联军，成就威名。东海龙神驾临汤谷，意外见到纤纤，道出一段不为人知的隐秘来。纤纤伤心欲绝，孤身踏上大荒，前往昆仑寻找生身母亲——西王母。拓跋野与蚩尤为寻纤纤，再次踏入大荒。
其时大荒已是危机四伏，火族圣杯失窃，纤纤被卷入失窃疑案，拓跋野、蚩尤二人为帮纤纤洗脱罪名，再次卷入大荒争端。火族逼供，纤纤梦呓圣杯落入雷神之手。拓跋野深入都城，与火族群雄一起踏上寻访之路；蚩尤暗中追寻，却遇上化身纤纤的九尾狐晏紫苏；此时，东海龙六携汤谷群雄齐至大荒。数人经过磨难，终于在雷神府中相遇，岂不料，竟集体陷入了木妖的圈套。雷神府祸乱骤起，雷神含冤逃走，宁姬莫名惨死，圣杯竟被劈成两半。为将圣杯复合。众人兵分两路，分别踏上了寻访土族朝歌山七彩土之路。
群雄远赴朝歌山，却恰逢土族贵人夭亡，拓跋野等途中突逢战斗。流沙仙子洛姬雅与土族少主姬远玄密林深处大肆拼杀。拓跋野帮助姬远玄逃得一难，并得知土族黄帝遭人暗杀，急需七彩土复活。在拓跋野的帮助下，姬远玄拜会灵山十巫，得到十巫相助，将黄帝救活。拓跋野与十巫斗智斗勇，并在洛姬雅的帮助下取得了神医的称号。当是时，土族都城却叛乱连连，土族大太子意自篡夺王位，在拓跋野等人的帮助下，姬远玄挫败了土旅叛军的阴谋，土族重归和平。
拓跋野等人携带七彩土再次回到火族，其时火族都城已是暗流涌动，大长老烈碧光晟困囚赤帝，意图篡位，烈炎等人身陷重围，危在旦夕，战争一触即发。拓跋野铤而走险，智救火族群雄；蚩尤奋不顾身，怒闯烈焰火山：赤炎山爆发喷薄，金猊兽咆哮出世，众人再次身陷险境。岂不料，金光塔变故骤起，赤帝脱困出关，战乱再度升级。大荒雨师，土族援军，火德之身，赤炎山头好戏连台。最终，火族战乱平息。大荒重归平静。
大荒格局暗显，火族南北并立，土族大乱方定，水族木族蓄势待发。五族之中只有金族保持中立。恰逢此时，纤纤再次负气出走。拓跋野与蚩尤为寻找纤纤再次踏上历险历程。在追寻的道路上，他们来到了大荒西陲寒荒之国。
其时寒荒却是祸乱连连：上古妖兽复出，国民离奇失踪。八族一齐叛乱。幕后黑手西海老祖不断兴风作浪，搅得寒荒大地一片大乱。二人在寒荒义士们的帮助下，共同斩妖除魔，解除寒荒危难，挫败西海老祖的阴谋。在金族少主少昊的帮助下，他们也顺利找到了纤纤，并将纤纤送往西荒金族其母亲所在地。岂不料，一波未平一波又起，西荒竟惊现尸蛊，无数大荒义士为尸蛊所控，成了嗜血妖魔。为查出真相，拓跋野与蚩尤深入西荒，却惊奇发现失踪已久的蚩尤之父乔羽、纤纤之父科汗淮等人都遭尸蛊所困，神志不清。蚩尤心急救父，强下九泉，勇闯鬼府，大战鬼府众魔，却被幽天鬼帝尸蛊所困，成为傀儡。
蟠桃大会如期召开，各族显贵要人齐聚昆仑瑶池。水族烛真神野心勃勃，暗地挑动五族不合；火族双帝齐至，剑拔弩张；木族暗附水族，蠢蠢欲动；土族动乱方平，蓄势待发。蟠桃大会，群英毕集，却都是各怀心思。岂不料祸乱骤起，蚩尤被幽天鬼帝所蛊，奋而刺杀土族黄帝，引起大乱，立刻成为五族公敌。拓跋野等人奋力救护，惹来麻烦连连。水族野心家借机四处挑拨。一时间，蟠桃大会风波频频，硝烟四起。拓跋野在西王母与白帝等人的帮助下，挺身而出，与火族、土族、龙族、金族等人共同结盟，将局势控制，并借机将蚩尤救出，助其摆脱尸蛊控制。
幽天鬼帝竟突袭会场，率领鬼府兵将大闹昆仑，并亮出了真实身份，原来鬼帝竟是失踪己久的水族黑帝。一时间，无数的旧日恩怨再次提起。昆仑山战云再起，蟠桃大会顿成修罗杀场。最后的时刻，拓跋野再逢奇遇，得自己的前世金族奇人古元坎相助，习得奇功，一举击败黑帝与烛真神，并获得“大荒天下第一”的称号，与蚩尤一同带着自己的爱人飞向茫茫东海。