高迎祥对李自成确实恩重如山，但李自成认为，高迎祥欠缺君临下的气度与能力，跟着他未必能实现他心中的理想，或者直白点，野心！
向来自负的李自成觉得，凡事还是得靠自己。如果自己是“闯王”，就绝对不会丢了商洛，而且现在官军早已被击溃了，闯军在陕南的大好形势也绝不会就这么毁于一旦了。
看着高迎祥所在屋子的门口，仅有十几个满脸憔悴的亲卫把守，李自成在冥冥中感觉，这是老爷给自己的机会。
他叫来了几个心腹，对他们道，“闯王途中惊心劳脾，以致重病难愈，若王薨则何如？”
几个心腹自然明白他这话的意思，立即道，“自是‘闯将’接位！”
李自成微微一笑，终于露出了狰狞，道，“既然这样，那我等就去送闯王一程吧！”
崇祯三年六月二十三日子时三刻，李自成的侄子李过带领两百人杀了高迎祥的十几名侍卫，闯入高迎祥屋中。沉睡中惊起的高迎祥很快被一群大汉按住，随后李过用湿毛巾将他捂死。
轰轰烈烈的一代闯王就此陨落，他或许做梦也没想到，自己会以这种方式结束一生。
随后，李自成又派人杀了哨所里的十几个兵，把现场收拾干净，就假称闯王病逝，然后载着他的遗体，班师回渭南城。
回师之后，李自成把闯王“病逝”的消息告诉了刘国能等人。刘国能有些怀疑，因为之前他并未听闯王生病的消息，而李自成去后短短几个时辰，闯王就“病逝”了？满腹疑问的他并不敢公开怀疑李自成，毕竟李自成的声望、权势远大于他，而且论兵马，李自成有近四万嫡系，而他才一万五六千。但是，怀疑的种子种下后，他决定暗中搞个清楚。
由于官军进逼在即，为稳定军心，所以渭南城按照李自成的安排，秘不发丧。但是李自成急于上位，自然是要通知各路流寇知晓这个事情的。
此时闯王帐下的各大将，如刘国能、满星、混王、一阵风、刘九思等都在渭南城中，李自成又通知了渭南附近的各路流寇，如崔山虎、七郎、九条龙等人，将这些人全部都召集到了渭南城，协商后续事宜。
毫无意外的，在众人的一致推举下，李自成就如同在历史上一样，在老闯王高迎祥死后，继承了“闯王”的名号，成为了各路流寇的新一任首领！
历经两年，李自成终于成了匪中之霸。
而就在李自成与各路首领会晤之际，刘国能悄悄借故外出，来到存放高迎祥遗体的地方，用钱买通了看守，得以进去“瞻仰遗容”。在屋里，刘国能在高迎祥的手臂等部位看到了几处抓痕，并且通过细细观察其口鼻异象，断定高迎祥是被人捂死，而绝非病死。
背后凉意阵阵的刘国能立即退出了屋子，并再次以重金贿赂看守，要他千万保守不要跟任何人提自己来过。看守自不会，要不然他也没好果子吃不是？
刘国能若无其事地回到屋中，与各路流寇一起继续商讨如何防卫渭南城。此时的他心中翻江倒海，他知道李自成既然会杀高迎祥，总有一也会杀他。因为就威望而言，无论在高迎祥部中还是在各路流寇心中，他都是仅次于李自成的存在。而且，他与李自成向来不合，手上还握着一万五大军，李自成就更有杀他的理由了。
但是事实上，李自成根本没想动刘国能，至少现在不会动。原因很简单，官军即将卷土重来，他在这个时候跟刘国能内讧岂不是找死？
以李自成的精明，自然不会做出这么傻的事情来。因此，在渭南大会上，李自成主动提出，将自己“闯将”的名号，给予刘国能。他希望借此能消除刘国能的疑虑。
但是刘国能身处极大的震惊与恐惧之中，根本不相信李自成。
渭南大会开了一整夜，并且在李自成的主持下，制定了较为完备的渭南防御方案。
按照这个方案，各路盟军和渭南城内的守军，依托坚固的渭南城进行内外联防，按照李自成的估计，守住半个月不成问题。而只要守住半个月，渭南就能保住了，因为他知道，北方的黄台吉已经南下了，秦书淮必须北上蓟镇去守卫京师——比起陕西来，京师自然重要百倍！而一旦秦书淮撤兵，他李自成必定能卷土重来。这次，他要控制陕西全境！
且秦书淮带四万五千大军，从商洛出发，沿板桥、李庙、东峪、九间房一线前往渭南。他的四万五千大军中，有五千是从投降的流寇之中挑选出的精壮之士。
秦书淮在出征前，并没有屠杀所有的投降流寇，这并非他一下子心慈手软了，而是他有两点考虑。其一，是官军的兵力目前严重不足，而且募兵困难，所以他打算从流寇中挑选一定数量的精壮之士，经过严加训练后，能为官军所用。他不担心这些流寇会反水，因为他们并没有什么坚定的信仰，加入高迎祥部只是为了混口饭吃而已，所以是可以归化的——当年蒙古人都可以归化大批被屠了城的流民帮他们战斗，现在他要归化同为汉人的流寇有什么不可以？其二，他需要这些降兵做个活广告，表明投降官军也未必会死，而且还能活的好好的，这样就可以降低其他流寇的战斗意志。
于是，他先杀了两万多降兵中的所有大头目，总计杀了两千多人，剩下的普通士兵中，他挑选了一万左右的精壮之士，打散后补充到各大营之中。而剩下的大都是老弱残兵，以及看上去獐头鼠目、油滑不定者（没错，就看面相不问缘由，谁让你是流寇？），则全部被秘密地、分批地带到城外某处，集体处决了！
言归正传。秦书淮在带大军南上之时，混在流寇队伍中的白莲教人发挥了巨大的作用。之前月长老有讲，白莲教近几年的经费，大多都花在灾民上了，事实上主要就花在了三边，因为三边灾民最多。也正因为如此，三边的很多灾民都加入了白莲教，被洗脑之后又混进了流寇的队伍中。在高迎祥部中的白莲教人还不算多，因为之前也了，高迎祥在内部进行过几次大清洗，清洗掉了不少白莲教人。但是，在其他各路流寇中的白莲教人就多了，据林林总总加起来至少有上千人之多，要不是秦书淮来三边了，这些白莲教人还想继续发展，要控制几股流寇呢！